Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDC1Q96MU7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YTHDC1Q96MU7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms