Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
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