Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C18orf8Q96DM3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms