Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LCN9Q8WX39 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms