Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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FOXD4Q12950 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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FOXD4Q12950 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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FOXD4Q12950 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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