Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OTUD4Q01804 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTUD4Q01804 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms