Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR4P51679 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR4P51679 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR4P51679 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms