Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms