Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PTGDSP41222 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTGDSP41222 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTGDSP41222 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTGDSP41222 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTGDSP41222 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGDSP41222 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGDSP41222 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGDSP41222 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTGDSP41222 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTGDSP41222 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGDSP41222 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGDSP41222 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGDSP41222 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGDSP41222 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTGDSP41222 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTGDSP41222 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGDSP41222 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTGDSP41222 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGDSP41222 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTGDSP41222 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGDSP41222 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGDSP41222 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTGDSP41222 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms