Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJC1P36383 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms