Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA3P25788 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms