Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HDGFL3Q9Y3E1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HDGFL3Q9Y3E1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HDGFL3Q9Y3E1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HDGFL3Q9Y3E1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HDGFL3Q9Y3E1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HDGFL3Q9Y3E1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HDGFL3Q9Y3E1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HDGFL3Q9Y3E1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HDGFL3Q9Y3E1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HDGFL3Q9Y3E1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HDGFL3Q9Y3E1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HDGFL3Q9Y3E1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HDGFL3Q9Y3E1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HDGFL3Q9Y3E1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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