Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4GALTQ9NPC4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms