Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms