Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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