Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms