Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG1Q06432 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms