Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms