Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms