Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASP9P55211 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CASP9P55211 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms