Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV4P43268 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETV4P43268 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETV4P43268 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms