Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms