Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK11BP21127 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK11BP21127 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK11BP21127 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK11BP21127 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK11BP21127 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK11BP21127 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK11BP21127 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK11BP21127 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK11BP21127 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK11BP21127 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK11BP21127 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK11BP21127 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK11BP21127 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK11BP21127 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK11BP21127 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms