Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms