Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HPGDP15428 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPGDP15428 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPGDP15428 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPGDP15428 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HPGDP15428 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms