Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX4O95219 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX4O95219 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX4O95219 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms