Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
L1RE1Q9UN81 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms