Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms