Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFKQ969G6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms