Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6P435 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6P435 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6P435 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6P435 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6P435 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6P435 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6P435 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6P435 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6P435 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6P435 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6P435 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6P435 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6P435 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6P435 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6P435 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6P435 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6P435 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6P435 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6P435 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6P435 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q6P435 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q6P435 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q6P435 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q6P435 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q6P435 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q6P435 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q6P435 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q6P435 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q6P435 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6P435 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6P435 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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