Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms