Protein–RNA interactions for Protein: Q16877

PFKFB4, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB4Q16877 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFKFB4Q16877 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms