Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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TRIP10Q15642 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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TRIP10Q15642 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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TRIP10Q15642 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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TRIP10Q15642 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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TRIP10Q15642 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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TRIP10Q15642 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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TRIP10Q15642 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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TRIP10Q15642 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
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