Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms