Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms