Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB4AP20338 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms