Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX24Q9Y343 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX24Q9Y343 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX24Q9Y343 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX24Q9Y343 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX24Q9Y343 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX24Q9Y343 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX24Q9Y343 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX24Q9Y343 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX24Q9Y343 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX24Q9Y343 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX24Q9Y343 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX24Q9Y343 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX24Q9Y343 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX24Q9Y343 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX24Q9Y343 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX24Q9Y343 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX24Q9Y343 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX24Q9Y343 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX24Q9Y343 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX24Q9Y343 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX24Q9Y343 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX24Q9Y343 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms