Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HHLA3Q9XRX5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms