Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAPRE3Q9UPY8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms