Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNMA8BQ9ULN7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1629.7 ms