Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCOLCE2Q9UKZ9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms