Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SALL4Q9UJQ4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms