Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM8A1Q9UBU6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
FAM8A1Q9UBU6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
FAM8A1Q9UBU6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
FAM8A1Q9UBU6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM8A1Q9UBU6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM8A1Q9UBU6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM8A1Q9UBU6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM8A1Q9UBU6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM8A1Q9UBU6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM8A1Q9UBU6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM8A1Q9UBU6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM8A1Q9UBU6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM8A1Q9UBU6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM8A1Q9UBU6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM8A1Q9UBU6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM8A1Q9UBU6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM8A1Q9UBU6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM8A1Q9UBU6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM8A1Q9UBU6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM8A1Q9UBU6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM8A1Q9UBU6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM8A1Q9UBU6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms