Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC4Q9UBN4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms