Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N5

RBM27, RNA-binding protein 27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM27Q9P2N5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBM27Q9P2N5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBM27Q9P2N5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM27Q9P2N5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM27Q9P2N5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM27Q9P2N5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms