Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI8

IGF2BP1, Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGF2BP1Q9NZI8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.243e-7■■■■■ 28.7
IGF2BP1Q9NZI8 TAB3-206ENST00000467136 7987 ntTSL 55.79□□□□□ -1.486e-7■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.696e-7■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.899e-7■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.989e-7■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.064e-9■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.14e-9■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.114e-9■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 MED15-211ENST00000433831 3267 ntTSL 514.21□□□□□ -0.134e-9■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.34e-9■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.227e-9■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.037e-9■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 MXD1-205ENST00000465446 490 ntTSL 27.79□□□□□ -1.167e-9■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 SRP14-AS1-201ENST00000504245 2317 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.382e-7■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 DNAJA2-201ENST00000317089 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 DNAJA2-202ENST00000563158 1825 ntTSL 510.37□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 USP34-208ENST00000467128 531 ntTSL 48.35□□□□□ -1.075e-27■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 USP34-212ENST00000476716 606 ntTSL 46.72□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 USP34-210ENST00000472689 776 ntTSL 56.43□□□□□ -1.383e-6■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 USP34-207ENST00000463046 6307 ntTSL 26.39□□□□□ -1.393e-6■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 PHF21A-202ENST00000418153 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.528e-7■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 PHF21A-207ENST00000527401 8954 ntTSL 210.67□□□□□ -0.78e-7■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 PHF21A-201ENST00000323180 3675 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.088e-7■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 ATF1-202ENST00000549612 568 ntTSL 519.25■□□□□ 0.672e-8■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 ATF1-204ENST00000552487 745 ntTSL 510.97□□□□□ -0.652e-8■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 ATF1-203ENST00000551831 970 ntTSL 26.07□□□□□ -1.442e-8■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 ATF1-205ENST00000552510 549 ntTSL 55.69□□□□□ -1.52e-8■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.942e-8■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 SLC22A23-212ENST00000497691 2555 ntTSL 1 (best)15.27■□□□□ 0.033e-11■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.143e-11■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 PABPC1-212ENST00000519622 667 ntTSL 54.63□□□□□ -1.678e-30■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 COPB2-201ENST00000333188 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.482e-7■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 COPB2-203ENST00000503326 433 ntTSL 34.23□□□□□ -1.732e-7■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.171e-7■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 SPPL2B-204ENST00000587851 586 ntTSL 321.4■■□□□ 1.021e-7■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.871e-7■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 SPPL2B-213ENST00000621568 1017 ntTSL 517.78■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 SPPL2B-201ENST00000585725 583 ntTSL 316.54■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 SPPL2B-203ENST00000586332 496 ntTSL 316.12■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.031e-7■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 ADARB1-207ENST00000460734 2523 ntTSL 1 (best)25.02■■□□□ 1.63e-8■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)21.82■■□□□ 1.083e-8■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)21.82■■□□□ 1.083e-8■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.083e-8■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)20.87■□□□□ 0.933e-8■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.553e-8■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.483e-8■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.353e-8■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.343e-8■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.173e-8■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 ADARB1-206ENST00000449478 704 ntTSL 515.81■□□□□ 0.123e-8■■■■■ 28.6
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IGF2BP1Q9NZI8 RAB17-206ENST00000414278 1511 ntTSL 215.38■□□□□ 0.053e-8■■■■■ 28.6
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IGF2BP1Q9NZI8 RAB17-208ENST00000430445 421 ntTSL 513.4□□□□□ -0.263e-8■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 ADARB1-208ENST00000462214 587 ntTSL 37.98□□□□□ -1.133e-8■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 ADARB1-209ENST00000464215 389 ntTSL 37.12□□□□□ -1.273e-8■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM56-RWDD3-201ENST00000604203 680 ntTSL 36.88□□□□□ -1.318e-7■■■■■ 28.6
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IGF2BP1Q9NZI8 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.245e-9■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 ALKBH5-202ENST00000490106 2146 ntTSL 1 (best)11.44□□□□□ -0.585e-9■■■■■ 28.6
IGF2BP1Q9NZI8 NDUFA4-203ENST00000470761 502 ntTSL 414.33□□□□□ -0.123e-16■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.445e-12■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 SNX1-203ENST00000558040 774 ntTSL 516.95■□□□□ 0.35e-12■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 SNX1-211ENST00000560829 1869 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.335e-12■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.355e-12■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 SNX1-212ENST00000560861 850 ntTSL 311.35□□□□□ -0.595e-12■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 SNX1-202ENST00000380285 8119 ntTSL 1 (best)9.63□□□□□ -0.875e-12■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 ATF7IP-213ENST00000539659 2298 ntTSL 212.46□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 SLC25A23-201ENST00000264088 2056 ntTSL 1 (best)24.51■■□□□ 1.516e-8■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.296e-8■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 SLC25A23-204ENST00000593600 834 ntTSL 316.3■□□□□ 0.26e-8■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 SLC25A23-211ENST00000600682 1210 ntTSL 214.07□□□□□ -0.166e-8■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 SLC25A23-206ENST00000595810 734 ntTSL 514.06□□□□□ -0.166e-8■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 SLC25A23-210ENST00000598908 888 ntTSL 313.15□□□□□ -0.36e-8■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 SLC25A23-213ENST00000601760 271 ntTSL 1 (best)10.21□□□□□ -0.776e-8■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 SLC25A23-209ENST00000598704 736 ntTSL 310.02□□□□□ -0.816e-8■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 SLC25A23-212ENST00000601322 526 ntTSL 38.42□□□□□ -1.066e-8■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.111e-10■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 SSR3-202ENST00000463503 596 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.666e-10■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.216e-10■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 MSMO1-205ENST00000507013 973 ntTSL 221.17■□□□□ 0.985e-7■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.55e-7■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 CERS2-209ENST00000482825 1618 ntTSL 512.52□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 SELENOP-214ENST00000514985 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.631e-8■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 SELENOP-209ENST00000511224 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.941e-8■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 SELENOP-203ENST00000506577 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.161e-8■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 SELENOP-210ENST00000512980 4175 ntTSL 26.84□□□□□ -1.311e-8■■■■■ 28.5
IGF2BP1Q9NZI8 TSPAN7-204ENST00000471410 1210 ntTSL 212.31□□□□□ -0.443e-9■■■■■ 28.4
IGF2BP1Q9NZI8 TSPAN7-205ENST00000475216 1224 ntTSL 211.75□□□□□ -0.533e-9■■■■■ 28.4
IGF2BP1Q9NZI8 TCF12-208ENST00000557947 575 ntTSL 421.42■■□□□ 1.026e-7■■■■■ 28.4
IGF2BP1Q9NZI8 PCGF5-203ENST00000496708 811 ntTSL 521.19■□□□□ 0.986e-9■■■■■ 28.4
IGF2BP1Q9NZI8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.686e-9■■■■■ 28.4
IGF2BP1Q9NZI8 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.096e-9■■■■■ 28.4
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