Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRNAU1APQ9NX07 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRNAU1APQ9NX07 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms