Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDLIM7Q9NR12 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDLIM7Q9NR12 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDLIM7Q9NR12 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms