Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPV4Q9HBA0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPV4Q9HBA0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRPV4Q9HBA0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms