Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMURF2Q9HAU4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms